Ο Κώστας Μπακογιάννης παντρεύτηκε το 2006 την Κύπρια επιχειρηματία Κάλλια Καμπουρίδου όταν ήταν 28 ετών και μαζί απέκτησαν δυο παιδιά: τον Παύλο που είναι σήμερα εννέα ετών και πήρε το όνομα του πατέρα του και τη Δανάη η οποία είναι σήμερα επτά ετών. To ζευγάρι χώρισε επτά χρόνια μετά.

Αυτά είναι τα δυο μεγαλύτερα από τα τέσσερα παιδιά του υποψήφιου Δημάρχου Αθηναίων και βρέθηκαν στο Ωδείο Αθηνών για να παρακολουθήσουν την παρουσίαση του προγράμματος του πατέρα τους, ο οποίος μόλις κατέβηκε από το βήμα τα αγκάλιασε θερμά και τα φίλησε. #daddygoals